Säätiön toimintaa valvoo valtuuskunta, johon kuuluu kymmenen jäsentä ja yhtä monta varajäsentä. Rauman kaupunginvaltuusto valitsee valtuuskunnan puheenjohtajan ja viisi jäsentä sekä varamiehet. Rauman Taideyhdistys ry:n hallitus valitsee varapuheenjohtajan ja kolme jäsentä sekä varamiehet.
Säätiön omaisuudesta ja asioiden hoidosta vastaa hallitus, johon valtuuskunta valitsee vuodeksi kerrallaan viisi jäsentä, näistä yhden puheenjohtajaksi. Hallitukseen tulee valita kolme jäsentä niistä henkilöistä, jotka Rauman kaupunginhallitus on asettanut ehdolle vaalia varten.